MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011901	GAGC	2	8	183	190	25 %	0 %	50 %	25 %	220933194
2	NC_011901	CAG	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
3	NC_011901	GGA	2	6	237	242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933194
4	NC_011901	CTG	2	6	259	264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
5	NC_011901	TTC	2	6	304	309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933194
6	NC_011901	GCG	2	6	348	353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933194
7	NC_011901	GCC	2	6	377	382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
8	NC_011901	CCG	2	6	428	433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
9	NC_011901	GCC	2	6	466	471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
10	NC_011901	CAA	2	6	489	494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933194
11	NC_011901	TCG	2	6	524	529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
12	NC_011901	CG	3	6	553	558	0 %	0 %	50 %	50 %	220933194
13	NC_011901	GCC	2	6	574	579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
14	NC_011901	CGG	2	6	615	620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933194
15	NC_011901	ATGC	2	8	646	653	25 %	25 %	25 %	25 %	220933194
16	NC_011901	GGT	2	6	693	698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933194
17	NC_011901	GCA	2	6	744	749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
18	NC_011901	CGA	2	6	759	764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
19	NC_011901	CTA	2	6	774	779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933194
20	NC_011901	GCT	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
21	NC_011901	CGA	2	6	804	809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
22	NC_011901	TTC	2	6	817	822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933194
23	NC_011901	TTC	2	6	850	855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933194
24	NC_011901	CAG	3	9	883	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
25	NC_011901	AGG	2	6	920	925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933194
26	NC_011901	GGA	2	6	936	941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933194
27	NC_011901	GCC	2	6	987	992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
28	NC_011901	CTT	2	6	1068	1073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933194
29	NC_011901	GTG	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933194
30	NC_011901	AGG	2	6	1181	1186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933194
31	NC_011901	CTG	2	6	1198	1203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
32	NC_011901	ACA	2	6	1232	1237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933194
33	NC_011901	AGA	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933194
34	NC_011901	TAC	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933194
35	NC_011901	ACCAC	2	10	1400	1409	40 %	0 %	0 %	60 %	220933194
36	NC_011901	TGC	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
37	NC_011901	TGCC	2	8	1419	1426	0 %	25 %	25 %	50 %	220933194
38	NC_011901	GGT	2	6	1431	1436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933194
39	NC_011901	CTG	2	6	1483	1488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
40	NC_011901	AGC	2	6	1498	1503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
41	NC_011901	GCA	2	6	1799	1804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933195
42	NC_011901	TGG	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933195
43	NC_011901	CGA	2	6	2003	2008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933195
44	NC_011901	GC	3	6	2064	2069	0 %	0 %	50 %	50 %	220933195
45	NC_011901	TGCCC	2	10	2081	2090	0 %	20 %	20 %	60 %	220933195
46	NC_011901	CCCTG	2	10	2102	2111	0 %	20 %	20 %	60 %	220933195
47	NC_011901	CAG	2	6	2123	2128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933195
48	NC_011901	TAC	2	6	2211	2216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933195
49	NC_011901	TG	3	6	2290	2295	0 %	50 %	50 %	0 %	220933195
50	NC_011901	CCT	2	6	2320	2325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933195
51	NC_011901	TCA	2	6	2335	2340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933195
52	NC_011901	CTG	2	6	2364	2369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933195
53	NC_011901	CTG	2	6	2373	2378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933195
54	NC_011901	TGA	2	6	2387	2392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933195
55	NC_011901	CTG	2	6	2622	2627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933195
56	NC_011901	ACCT	2	8	2721	2728	25 %	25 %	0 %	50 %	220933195
57	NC_011901	CTG	2	6	3004	3009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
58	NC_011901	CCAT	2	8	3014	3021	25 %	25 %	0 %	50 %	220933196
59	NC_011901	CTC	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933196
60	NC_011901	TTCC	2	8	3039	3046	0 %	50 %	0 %	50 %	220933196
61	NC_011901	GGC	3	9	3121	3129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933196
62	NC_011901	CTG	2	6	3259	3264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
63	NC_011901	GCG	2	6	3269	3274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933196
64	NC_011901	CCG	2	6	3285	3290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933196
65	NC_011901	GCT	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
66	NC_011901	CTG	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
67	NC_011901	GCT	2	6	3408	3413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
68	NC_011901	AGA	2	6	3570	3575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933196
69	NC_011901	CTG	2	6	3658	3663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
70	NC_011901	GCC	2	6	3665	3670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933196
71	NC_011901	CAG	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933196
72	NC_011901	GTG	2	6	3721	3726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933196
73	NC_011901	TGG	2	6	3791	3796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933196
74	NC_011901	CGG	2	6	3806	3811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933196
75	NC_011901	TGA	2	6	3839	3844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933196
76	NC_011901	CTGC	2	8	3846	3853	0 %	25 %	25 %	50 %	220933196
77	NC_011901	TCGGG	2	10	3957	3966	0 %	20 %	60 %	20 %	220933196
78	NC_011901	GCA	2	6	4032	4037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
79	NC_011901	CAC	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
80	NC_011901	GGT	2	6	4161	4166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
81	NC_011901	CGA	2	6	4179	4184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
82	NC_011901	CAA	2	6	4203	4208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933197
83	NC_011901	ATC	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
84	NC_011901	GAT	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933197
85	NC_011901	GAA	2	6	4288	4293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933197
86	NC_011901	GGTC	2	8	4294	4301	0 %	25 %	50 %	25 %	220933197
87	NC_011901	CGC	2	6	4302	4307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
88	NC_011901	TCA	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
89	NC_011901	TGC	2	6	4325	4330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
90	NC_011901	GCGG	2	8	4333	4340	0 %	0 %	75 %	25 %	220933197
91	NC_011901	CGA	2	6	4347	4352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
92	NC_011901	CGG	2	6	4371	4376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933197
93	NC_011901	GGTGTG	2	12	4384	4395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
94	NC_011901	GGT	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
95	NC_011901	C	6	6	4490	4495	0 %	0 %	0 %	100 %	220933197
96	NC_011901	GGTG	2	8	4503	4510	0 %	25 %	75 %	0 %	220933197
97	NC_011901	TCT	2	6	4559	4564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933197
98	NC_011901	TCCT	2	8	4615	4622	0 %	50 %	0 %	50 %	220933197
99	NC_011901	CGA	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
100	NC_011901	AGG	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933197
101	NC_011901	CAA	2	6	4725	4730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933197
102	NC_011901	C	6	6	4733	4738	0 %	0 %	0 %	100 %	220933197
103	NC_011901	GAC	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
104	NC_011901	TCT	2	6	4829	4834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933197
105	NC_011901	CAA	2	6	4842	4847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933197
106	NC_011901	GCAC	2	8	4868	4875	25 %	0 %	25 %	50 %	220933197
107	NC_011901	CGC	2	6	4890	4895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
108	NC_011901	GAA	2	6	4941	4946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933197
109	NC_011901	CCA	2	6	4958	4963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
110	NC_011901	TGA	2	6	4968	4973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933197
111	NC_011901	TCC	2	6	5056	5061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933197
112	NC_011901	GTG	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
113	NC_011901	ACC	2	6	5096	5101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
114	NC_011901	CTG	2	6	5113	5118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
115	NC_011901	TCA	2	6	5141	5146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
116	NC_011901	ATC	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
117	NC_011901	CG	4	8	5166	5173	0 %	0 %	50 %	50 %	220933197
118	NC_011901	CCG	2	6	5187	5192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
119	NC_011901	GGCC	2	8	5232	5239	0 %	0 %	50 %	50 %	220933197
120	NC_011901	TGG	2	6	5297	5302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
121	NC_011901	CCG	2	6	5312	5317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
122	NC_011901	CGG	2	6	5423	5428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933197
123	NC_011901	ACC	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
124	NC_011901	CAT	4	12	5508	5519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
125	NC_011901	CTG	3	9	5557	5565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
126	NC_011901	CTT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933197
127	NC_011901	GCC	2	6	5625	5630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
128	NC_011901	GAA	2	6	5643	5648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933197
129	NC_011901	CAA	2	6	5688	5693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933197
130	NC_011901	TGC	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
131	NC_011901	GGA	2	6	5715	5720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933197
132	NC_011901	TGA	2	6	5729	5734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933197
133	NC_011901	CCG	2	6	5749	5754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
134	NC_011901	GCG	2	6	5759	5764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933197
135	NC_011901	GGA	2	6	5772	5777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933197
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251	NC_011901	GCG	2	6	11335	11340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933201
252	NC_011901	CGTGGC	2	12	11390	11401	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220933201
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257	NC_011901	ATCC	2	8	11571	11578	25 %	25 %	0 %	50 %	220933201
258	NC_011901	CTA	2	6	11621	11626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933201
259	NC_011901	CCG	2	6	11715	11720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933201
260	NC_011901	GCC	2	6	11810	11815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933201
261	NC_011901	GTG	2	6	11841	11846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933201
262	NC_011901	TGA	2	6	11884	11889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933201
263	NC_011901	TCCT	2	8	11901	11908	0 %	50 %	0 %	50 %	220933201
264	NC_011901	CCCG	2	8	12009	12016	0 %	0 %	25 %	75 %	220933201
265	NC_011901	TGA	2	6	12025	12030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933201
266	NC_011901	CCA	2	6	12106	12111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933201
267	NC_011901	ACC	2	6	12129	12134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933201
268	NC_011901	GCG	2	6	12176	12181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933201
269	NC_011901	CGA	2	6	12185	12190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933201
270	NC_011901	CAT	2	6	12367	12372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933202
271	NC_011901	GGT	2	6	12389	12394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933202
272	NC_011901	GTG	2	6	12455	12460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933202
273	NC_011901	GCCTG	2	10	12489	12498	0 %	20 %	40 %	40 %	220933202
274	NC_011901	GC	3	6	12506	12511	0 %	0 %	50 %	50 %	220933202
275	NC_011901	GGC	2	6	12519	12524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933202
276	NC_011901	TGA	2	6	12585	12590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933202
277	NC_011901	CGG	3	9	12603	12611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933202
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279	NC_011901	TGC	2	6	12669	12674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933202
280	NC_011901	GC	3	6	12691	12696	0 %	0 %	50 %	50 %	220933202
281	NC_011901	AAG	2	6	12746	12751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933202
282	NC_011901	GCTC	2	8	12757	12764	0 %	25 %	25 %	50 %	220933202
283	NC_011901	TGG	2	6	12765	12770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933202
284	NC_011901	GCC	2	6	12881	12886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933202
285	NC_011901	CGGCAT	2	12	12892	12903	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933202
286	NC_011901	CAT	2	6	12955	12960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933202
287	NC_011901	CAGC	2	8	12982	12989	25 %	0 %	25 %	50 %	220933202
288	NC_011901	ATC	2	6	13006	13011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933203
289	NC_011901	GAG	2	6	13117	13122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933203
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291	NC_011901	CGC	2	6	13158	13163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933203
292	NC_011901	CTG	2	6	13264	13269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933203
293	NC_011901	GGCCGC	2	12	13272	13283	0 %	0 %	50 %	50 %	220933203
294	NC_011901	GAGCCA	2	12	13341	13352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933204
295	NC_011901	TGG	2	6	13437	13442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933204
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298	NC_011901	GCG	2	6	13515	13520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933204
299	NC_011901	GCG	2	6	13534	13539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933204
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302	NC_011901	GCC	2	6	13718	13723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933205
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332	NC_011901	TCG	2	6	16849	16854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933209
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381	NC_011901	GC	3	6	19117	19122	0 %	0 %	50 %	50 %	220933213
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389	NC_011901	CGG	2	6	19380	19385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933213
390	NC_011901	CTT	2	6	19398	19403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933213
391	NC_011901	CGG	2	6	19422	19427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933213
392	NC_011901	GGCCCT	2	12	19503	19514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933213
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